Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Irf1P15314 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf1P15314 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf1P15314 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Irf1P15314 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Irf1P15314 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Irf1P15314 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf1P15314 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Irf1P15314 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Irf1P15314 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Irf1P15314 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Irf1P15314 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Irf1P15314 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Irf1P15314 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Irf1P15314 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Irf1P15314 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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