Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd1P13516 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd1P13516 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scd1P13516 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd1P13516 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms