Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vpreb2P13373 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Vpreb2P13373 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms