Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PolP11369 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PolP11369 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PolP11369 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolP11369 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolP11369 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms