Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Amd1P0DMN7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms