Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Zfp1P08042 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Zfp1P08042 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Zfp1P08042 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Zfp1P08042 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfp1P08042 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms