Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lamc1P02468 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc1P02468 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms