Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-AaP01910 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-AaP01910 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-AaP01910 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H2-AaP01910 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-AaP01910 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-AaP01910 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-AaP01910 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-AaP01910 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-AaP01910 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-AaP01910 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-AaP01910 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-AaP01910 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-AaP01910 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-AaP01910 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-AaP01910 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-AaP01910 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-AaP01910 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
H2-AaP01910 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
H2-AaP01910 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms