Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01735 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01735 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01735 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01735 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01735 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01735 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01735 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01735 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01735 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01735 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01735 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01735 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01735 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01735 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01735 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01735 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01735 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01735 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01735 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01735 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01735 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01735 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01735 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01735 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01735 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01735 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01735 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01735 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01735 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01735 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01735 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01735 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01735 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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