Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01672 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01672 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01672 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01672 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01672 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01672 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01672 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01672 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01672 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01672 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01672 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01672 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01672 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01672 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01672 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01672 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01672 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01672 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01672 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01672 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01672 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01672 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01672 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01672 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01672 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01672 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01672 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01672 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01672 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01672 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01672 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01672 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01672 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01672 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01672 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01672 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01672 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01672 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01672 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01672 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01672 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01672 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms