Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01656 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01656 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01656 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01656 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01656 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01656 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01656 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01656 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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