Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01654 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01654 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01654 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01654 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01654 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01654 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01654 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01654 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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