Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hcn2O88703 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hcn2O88703 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms