Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BlmO88700 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BlmO88700 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BlmO88700 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BlmO88700 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BlmO88700 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BlmO88700 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BlmO88700 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BlmO88700 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BlmO88700 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BlmO88700 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BlmO88700 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BlmO88700 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BlmO88700 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BlmO88700 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BlmO88700 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BlmO88700 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BlmO88700 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BlmO88700 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BlmO88700 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BlmO88700 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BlmO88700 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BlmO88700 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BlmO88700 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BlmO88700 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BlmO88700 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BlmO88700 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BlmO88700 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BlmO88700 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BlmO88700 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BlmO88700 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BlmO88700 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BlmO88700 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BlmO88700 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BlmO88700 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BlmO88700 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BlmO88700 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BlmO88700 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BlmO88700 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BlmO88700 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BlmO88700 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BlmO88700 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BlmO88700 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BlmO88700 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BlmO88700 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BlmO88700 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BlmO88700 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BlmO88700 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BlmO88700 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BlmO88700 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BlmO88700 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BlmO88700 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BlmO88700 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BlmO88700 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BlmO88700 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BlmO88700 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BlmO88700 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BlmO88700 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BlmO88700 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BlmO88700 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BlmO88700 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BlmO88700 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BlmO88700 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BlmO88700 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BlmO88700 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BlmO88700 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BlmO88700 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BlmO88700 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BlmO88700 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BlmO88700 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BlmO88700 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BlmO88700 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BlmO88700 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BlmO88700 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BlmO88700 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BlmO88700 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BlmO88700 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BlmO88700 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BlmO88700 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BlmO88700 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BlmO88700 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms