Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp2a2O55143 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2a2O55143 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms