Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc3O55013 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc3O55013 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms