Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2f6O54917 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2f6O54917 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms