Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Itgb3O54890 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Itgb3O54890 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms