Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp10aO54827 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp10aO54827 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms