Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
DffbO54788 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DffbO54788 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffbO54788 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffbO54788 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffbO54788 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DffbO54788 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DffbO54788 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DffbO54788 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DffbO54788 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DffbO54788 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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