Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Limk2O54785 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Limk2O54785 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms