Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srpk2O54781 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srpk2O54781 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms