Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CrxO54751 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms