Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdc4O35988 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms