Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FxnO35943 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FxnO35943 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FxnO35943 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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FxnO35943 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FxnO35943 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FxnO35943 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FxnO35943 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FxnO35943 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FxnO35943 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FxnO35943 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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FxnO35943 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FxnO35943 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FxnO35943 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FxnO35943 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FxnO35943 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FxnO35943 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FxnO35943 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FxnO35943 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FxnO35943 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FxnO35943 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FxnO35943 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FxnO35943 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FxnO35943 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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FxnO35943 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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