Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek2O35942 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nek2O35942 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nek2O35942 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek2O35942 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nek2O35942 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms