Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gp1baO35930 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gp1baO35930 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms