Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Klf9O35739 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Klf9O35739 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Klf9O35739 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Klf9O35739 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf9O35739 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms