Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Phox2bO35690 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Phox2bO35690 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms