Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edil3O35474 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Edil3O35474 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms