Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcc1O35379 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcc1O35379 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms