Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe40O35185 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms