Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Polr1aO35134 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.1 ms