Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Eftud2O08810 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Eftud2O08810 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms