Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MttpO08601 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MttpO08601 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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MttpO08601 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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MttpO08601 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MttpO08601 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MttpO08601 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms