Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smim18J3QNP2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smim18J3QNP2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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