Protein–RNA interactions for Protein: J3QNG1

Gm6408, Predicted gene 6408, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6408J3QNG1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6408J3QNG1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms