Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3336J3QMQ6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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