Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm6176J3QK59 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm6176J3QK59 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm6176J3QK59 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm6176J3QK59 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm6176J3QK59 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm6176J3QK59 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm6176J3QK59 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm6176J3QK59 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm6176J3QK59 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Gm6176J3QK59 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm6176J3QK59 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm6176J3QK59 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm6176J3QK59 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Gm6176J3QK59 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm6176J3QK59 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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