Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21060J3KMU4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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