Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21897J3KMP5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms