Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HrcG5E8J6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HrcG5E8J6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms