Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmgxb3G3X9M3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms