Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arfgef1G3X9K3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arfgef1G3X9K3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms