Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
2610008E11RikG3X964 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
2610008E11RikG3X964 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms