Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ercc6F8VPZ5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc6F8VPZ5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms