Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm28038F7BCN9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm28038F7BCN9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms