Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm8247F6VRJ8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8247F6VRJ8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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