Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17555F6U8B9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm17555F6U8B9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms