Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Raph1F2Z3U3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms